他一開始帶研究生時，沒有讓學生單純去查閱文獻和做動物實驗，而是在加強學習經典理論的同時，著重培養和提高學生臨床辨證論治的能力，按照中醫傳統師帶徒的方式，讓學生隨自己出診，抄方看病。學生們通過侍診的形式，在臨床上掌握更多的中醫藥知識，讓學生親眼目睹中醫看病的療效。另一方面結合具體的病例進行點評，使學生通過長期跟師學習，耳濡目染，將老師的學術經驗學到手，在臨床用藥和臨床療效上有所提高。

　　2010年12月，張琪在研究室與他的研究生和學術繼承人研究科研方案。

　　良師誨人不倦，大醫精誠仁愛。教書育人時，張琪從不把自己的經驗和醫術視為私有財富，對所有學生不藏私，傾囊相授，對學生的教導嘔心瀝血，循循善誘，甘為人梯。他常說：『一個人醫術再好，能治多少人？不要保守，讓更多人能學會治病，給更多的人治病，這就是為醫的目的。』他認為只有臨床纔能學到真本領，要求研究生必須按時出門診，對寒暑假日都跟著出診的勤奮學生，張琪特別喜愛，贊不絕口；接待患者時，他總是態度平和、語調親切，就像對待親人一般，他的朴實無華、精湛醫術贏得了廣大患者的一致稱贊，也贏得了學生們的尊敬與愛戴。

　　隨同張琪一起出診的學生們認真做抄方筆記。東北網記者 杜筱 攝

　　為培養更多人纔，張琪不顧年事已高，堅持帶研究生。他說：『自己還能乾幾年？帶徒纔有意義。』張琪教授共培養醫學博士40名，其中1名在讀；醫學碩士8名；全國名老中醫學術經驗繼承人9名；博士後4名。廣東省中醫院師承學生3人，浙江省中醫院師承學生1名。全國優秀中醫臨床人纔拜師學員20餘名。其中，博士碩士學術繼承人中有25人，在全國不同省市承擔著各自學科或專科帶頭人工作。國家中醫藥管理局科技司司長曹洪欣、黑龍江中醫藥大學附屬醫院院長姜德友、天津中醫藥大學內分泌中心主任吳深濤、北京中醫藥大學東方醫院腎病科主任王暴魁等醫中翹楚，都曾師從張琪。